|
|
| Line 32: |
Line 32: |
| <table class="wikitable mw-collapsible" style="float:left;"><tr><th scope="col">TF expression and enrichment</th></tr><tr><td> | | <table class="wikitable mw-collapsible" style="float:left;"><tr><th scope="col">TF expression and enrichment</th></tr><tr><td> |
| <div style="height:300px; overflow:auto; resize:both;"> | | <div style="height:300px; overflow:auto; resize:both;"> |
| {{#motif_gotable:GO:0032501!multicellular organismal process!6.08922522190432e-05!9990;10505;54456;1267;26520;4976;3347;2296;128178;3084;415;5367;680;7857;4033;171392;1238;11243;10371;5648;55755;4184;729;5896;1538;5961;10692$GO:0048869!cellular developmental process!0.000387775797717877!10505;79960;54456;4976;2296;2620;128178;3084;5367;7857;4033;171392;11243;10371;55755;729;5896;1538$GO:0030154!cell differentiation!0.000387775797717877!10505;79960;54456;4976;2296;2620;128178;3084;5367;7857;4033;171392;11243;10371;55755;729;5896;1538$GO:0032502!developmental process!0.00233671081325492!10505;79960;54456;4976;6464;3347;2296;2620;128178;3084;415;5367;7857;4033;171392;1238;11243;10371;55755;729;5896;1538$GO:0007275!multicellular organismal development!0.00286347421679379!10505;54456;3347;2296;128178;3084;415;5367;7857;4033;171392;1238;11243;10371;55755;5896;1538$GO:0019953!sexual reproduction!0.00353397379123732!54456;1538;64149;5367;2296;4184;10863$GO:0007276!gamete generation!0.00972130578276603!54456;1538;64149;5367;2296;10863$GO:0031214!biomineral formation!0.00972130578276603!171392;11243;3347;2296$GO:0001503!ossification!0.00972130578276603!171392;11243;3347;2296$GO:0046849!bone remodeling!0.0122621498861411!171392;11243;3347;2296$GO:0007516!hemocyte development!0.0124230489776629!5896;4033$GO:0048771!tissue remodeling!0.0129919132621044!171392;11243;3347;2296$GO:0042386!hemocyte differentiation!0.0129919132621044!5896;4033$GO:0007007!inner mitochondrial membrane organization and biogenesis!0.0129919132621044!26520;4976$GO:0045670!regulation of osteoclast differentiation!0.0139569019484187!171392;11243$GO:0001501!skeletal development!0.0139569019484187!171392;11243;3347;2296;415$GO:0007283!spermatogenesis!0.0139569019484187!54456;1538;64149;5367;10863$GO:0048232!male gamete generation!0.0139569019484187!54456;1538;64149;5367;10863$GO:0048856!anatomical structure development!0.0142886224012376!171392;10505;79960;11243;10371;6464;3347;2296;55755;2620;415;5896;7857;4033$GO:0030316!osteoclast differentiation!0.017770567472531!171392;11243$GO:0048468!cell development!0.0214275528812134!10505;79960;54456;4976;2296;55755;2620;729;5896;7857;4033$GO:0045453!bone resorption!0.0228309998815824!171392;11243$GO:0016042!lipid catabolic process!0.0263296618681581!285848;345557;26279;200879$GO:0002761!regulation of myeloid leukocyte differentiation!0.0280747614833648!171392;11243$GO:0043231!intracellular membrane-bound organelle!0.0322966228779581!79960;1267;6464;2296;60561;199704;8559;7748;9014;168391;4033;8335;10346;10714;7365;91120;10741;359787;26986;4666;10505;4976;26520;22926;415;3084;4110;171392;5693;23314;4184;1106;1555;7385;5896;1538;22882$GO:0043227!membrane-bound organelle!0.0322966228779581!79960;1267;6464;2296;60561;199704;8559;7748;9014;168391;4033;8335;10346;10714;7365;91120;10741;359787;26986;4666;10505;4976;26520;22926;415;3084;4110;171392;5693;23314;4184;1106;1555;7385;5896;1538;22882$GO:0030097!hemopoiesis!0.0322966228779581!171392;5896;11243;4033$GO:0048871!multicellular organismal homeostasis!0.0363232495251549!171392;11243$GO:0001894!tissue homeostasis!0.0363232495251549!171392;11243$GO:0030278!regulation of ossification!0.0363232495251549!171392;11243$GO:0048534!hemopoietic or lymphoid organ development!0.0366946086738554!171392;5896;11243;4033$GO:0007006!mitochondrial membrane organization and biogenesis!0.037770852979197!26520;4976$GO:0002520!immune system development!0.041531673853049!171392;5896;11243;4033$GO:0009605!response to external stimulus!0.043038571048844!56995;1238;26279;5648;729;680;7857$GO:0002521!leukocyte differentiation!0.0484322432752951!171392;5896;11243$GO:0046850!regulation of bone remodeling!0.0484322432752951!171392;11243}} | | {{#motif_gotable:GO:0009653!anatomical structure morphogenesis!0!5962;7080;79006;64399;51162;2011;10435;7528;8575;1875;27122;114787;6091;1655;57534;8811;2273;285;3791;57125;26257;5653;7482;668;1101;9578;7716;9993;286;148170;10220;7051;9024;146;247;6015;9826;858;1045;333;5921;8829;8408;1906;56994;9817;5364;55704;634;5307;10644;88;4762;63923;5228;9564;1020;5986;2735;9637;9306;4838;3490;7468;5649;6299;10500;5454;90;5371;7410;4628;3753;2149;1306;79068;1395;652;928;27345;7423;51293;6608;1474;7424;28514;10804;84518;7026;2028;1627;1154;10718;79960;136;3996;23493;84612;1285;2535;5311;3169;4041;10477;239;1950;51330;2683;7286;94031;2239;3912;8626;8828;55201;6092;2245;4856;116039;10276;10458;7869;1044;29946;10487;145258;23191;9935;10736;54538;10908;2064;94;3679;1605;1739;79784;23764;4846;84312;5013;9053;10052;7472;4982;57556;56963;2730;2619;7248;6585;5518;2548;51085;7422;1464;6599;10752;7262;3485;4804;10643;51458;65009;4162;30837;2729;3489;23612;9788;5493;1054;1139;646982;1816;3399;53834;10856;6926;2302;3239;10395;64976;8214;6322;2261;4320;5076;8100;80781;6692;64321;3673;7089;4087;636;817;3265;6665;2118;57216;2125;2119;8742;23607;2775;2253;3201;56896;94234;9344;30061;2050;10630;83439;153;92304;7161;57194;27019;7533;10675;22955;131566;23405;5156;1770;6657;4131;27022;6911;2201;7137;29842;5216;2055;83787;55540;9166;7474;394;28959;357;2697;6997;89780;54904;1032;9620;25806;124590;3725;3487;6461;57142;81621;4741;657;51129;91;166;51232;349667;2596;10818;1947;6477;323;7471;259230;5584;4625;1495;10505;147040;5594;5309;7379;3875;471;2295;2719;4779;147;6586;83605;1368;1949;55636;5064;11135;8218;7088;6722;2249;64121;112398;1856;83478;3764;2070;677;146760;8817;1499;8851;4855;9314;4920;673;4154;6425;10857;1295;2321;222662;3861;207;80115;10252;4897;10205;5460;375611;51804;50509;27120;51196;2023;2637;4088;3984;6096;348;7052;83992;688;1466;23462;4692;80303;8633;6604;388;5654;2034;51474;23433;4983;435;9423;55109;9048;4739;2054;1907;65981;2053;57045;5881;7855;354;6050;55971;25861;54434;1002;7054;1051;2260;85358;5062;4624;2022;2006;1908;11202;9655;2294;154796;760;7414;8804;9421;1855;2593;1399;2303;79582;4062;2049;9394;1191;2247;55558;10083;7039;9253;183}} |
| </div> | | </div> |
| </td></tr></table> | | </td></tr></table> |
Revision as of 18:43, 13 April 2012
motif without matrices
Swissregulon:SRY.p1
Swissregulon:HOX(A,B,D)3.p1
doubled top motif tables
CNhs10855 & CNhs11062
CNhs11245 & CNhs11183
CNhs11248 & CNhs11185
CNhs11772 & CNhs12996
CNhs11781 & CNhs12997
tooltipMotif:PAX8.p1<br>Gene:7849
pax8
link
PAX8
| TF expression and enrichment |
|---|
|
|
CAGE Peaks (hg19)
Sample of clicked point:
|
|
Mm9::chr4:32744082..32744141,+ | Mm9::chr4:32744082..32744141,+ | Mm9::chr4:32744159..32744169,+ | Mm9::chr4:32744159..32744169,+ | Mm9::chr4:32809978..32809991,+ | Mm9::chr4:32809978..32809991,+ | Mm9::chr4:32810017..32810026,+ | Mm9::chr4:32810017..32810026,+ | Mm9::chr4:32837666..32837670,+ | Mm9::chr4:32837666..32837670,+ |
