Personal tools

User:Hisa: Difference between revisions

From FANTOM5_SSTAR

Jump to: navigation, search
No edit summary
No edit summary
Line 27: Line 27:
<script type="text/javascript">
<script type="text/javascript">
$(document).ready(function() {
$(document).ready(function() {
var motifs = ['ZBT7A_f1','ZBTB16','ZBTB4!METH_f1','ZBTB4_si','ZBTB6_si','ZEP2_si','ZFP161','ZN219_f1','ZN333_f1','ZN350_f1','ZN384_f1','ZN423_f1','ZN589_f1','ZNF143','motif10','motif1026','motif103','motif1032','motif1044','motif1049','motif106','motif1068','motif1097','motif11','motif119','motif123','motif125','motif134','motif136','motif143','motif145','motif162','motif177','motif183','motif189','motif196','motif198','motif199','motif210','motif218','motif222','motif233','motif238','motif247','motif252','motif260','motif261','motif263','motif27','motif282','motif29','motif290','motif293','motif297','motif3','motif30','motif300','motif301','motif307','motif313','motif316','motif324','motif33','motif335','motif351','motif357','motif359','motif361','motif365','motif37','motif373','motif378','motif382','motif41','motif415','motif424','motif432','motif44','motif440','motif441','motif443','motif445','motif459','motif46','motif461','motif463','motif468','motif475','motif477','motif478','motif486','motif489','motif494','motif498','motif499','motif515','motif516','motif517','motif527','motif550','motif553','motif554','motif558','motif560','motif561','motif563','motif568','motif57','motif577','motif585','motif588','motif602','motif606','motif61','motif614','motif624','motif627','motif64','motif647','motif66','motif660','motif667','motif668','motif670','motif679','motif680','motif682','motif684','motif686','motif688','motif74','motif75','motif77','motif80','motif816','motif822','motif827','motif830','motif835','motif837','motif839','motif843','motif858','motif861','motif867','motif87','motif882','motif885','motif886','motif890','motif895','motif897','motif898','motif9','motif90','motif906','motif909','motif915','motif929','motif931','motif935','motif943','motif944','motif950','motif953','motif956','motif957','motif963','motif965','motif969','motif97','motif970','motif977','motif981','motif990','motif991','motif999','motif_AAGTCN','motif_ACAGTN','motif_ACNGGT','motif_ACTGGN','motif_AGGGCN','motif_AGNCGT','motif_AGNCTT','motif_ANAGCT','motif_ANCAGT','motif_ANCGCT','motif_ANCTGT','motif_ANGACT','motif_ANGCCT','motif_ANGTCT','motif_ANTGCT','motif_ATGNCT','motif_ATNGCT','motif_CAAGTNNCA','motif_CACNGT','motif_CAGNAT','motif_CAGNCT','motif_CAGNGT','motif_CAGTNT','motif_CANCTG','motif_CANGTT','motif_CANTTG','motif_CATGNT','motif_CCAGCN','motif_CCANGT','motif_CCANTG','motif_CCCTNA','motif_CCNAGT','motif_CCNGAT','motif_CCNGCA','motif_CCNGGA','motif_CGACNT','motif_CGANCT','motif_CGNTGA','motif_CNAATG','motif_CNACTG','motif_CNAGGT','motif_CNAGTCTC','motif_CNAGTT','motif_CNATGG','motif_CNCAGT','motif_CNCATG','motif_CNGAAT','motif_CNGACT','motif_CNGATG','motif_CNGATT','motif_CNGCAG','motif_CNGCAT','motif_CNGCCA','motif_CNGGAT','motif_CNGGTA','motif_CTAGNG','motif_CTAGNT','motif_CTANGG','motif_CTATGN','motif_CTCANG','motif_CTGGGN','motif_CTGGNG','motif_CTNAGT','motif_CTNATG','motif_CTNGAT','motif_CTNTAG','motif_CTTANG','motif_CTTNAG','motif_GAACNT','motif_GAAGNT','motif_GACNCT','motif_GACNGT','motif_GACNTG','motif_GAGNCT','motif_GANACT','motif_GANCAT','motif_GANGTC','motif_GANTCT','motif_GANTTC','motif_GATCTN','motif_GATNTC','motif_GCAANT','motif_GCAATN','motif_GCACNT','motif_GCANTG','motif_GCNACT','motif_GCNCAT','motif_GCNGAT','motif_GCTCANGG','motif_GCTNAT','motif_GGACTN','motif_GGAGCN','motif_GGANTC','motif_GGCANT','motif_GGCNAT','motif_GGCNCA','motif_GGGACN','motif_GGNATC','motif_GGNCAT','motif_GNAATC','motif_GNACAT','motif_GNACCT','motif_GNACTT','motif_GNATCC','motif_GNATCT','motif_GNATTC','motif_GNCAAT','motif_GNCATC','motif_GNCATG','motif_GNCATT','motif_GNCTAG','motif_GNGAGC','motif_GNGCTA','motif_GNTACC','motif_GNTACT','motif_GNTCAT','motif_GTAANC','motif_GTACTN','motif_GTANCT','motif_GTCANC','motif_GTCANG','motif_GTCATN','motif_GTCNAG','motif_GTNACC','motif_GTNACT','motif_GTNATC','motif_GTNCAT','motif_GTNGAC','motif_GTTNAC','motif_TAACNG','motif_TAANGC','motif_TACANG','motif_TACTGN','motif_TAGCNG','motif_TAGGNC','motif_TAGNCT','motif_TAGNGC','motif_TAGNTC','motif_TAGTNC','motif_TANAGC','motif_TCAANG','motif_TCACNG','motif_TCAGNT','motif_TCCNGC','motif_TCNAGT','motif_TCNGAG','motif_TCNGGA','motif_TCTNAG','motif_TGAANC','motif_TGACNC','motif_TGACNG','motif_TGANAC','motif_TGANCT','motif_TGCNAG','motif_TGCTAN','motif_TGGAGN','motif_TGNACC','motif_TGNACT','motif_TGNCAC','motif_TGNCAT','motif_TGNCCA','motif_TGNCTA','motif_TGNGAC','motif_TGNTCA','motif_TGTANC','motif_TGTNAC','motif_TNAAGC','motif_TNAGCA','motif_TNAGCC','motif_TNAGGC','motif_TNATGC','motif_TNCAAG','motif_TNCACG','motif_TNCAGA','motif_TNCAGT','motif_TNCATG','motif_TNCGCA','motif_TNCTAG','motif_TNCTGA','motif_TNGACA','motif_TNGGAC','motif_TNGGCA','motif_TNTAGC','motif_TNTGCA','motif_TTACNG','motif_TTCANG','motif_TTCNGA','motif_TTGACN','motif_TTGCAN','motif_TTGNCA','motif_TTNAGC','motif_TTNCAG'];
var motifs = ['1-CAATGACATC,CNhs11969,BestGuess:CREM_f1_HM09(0.737411560462348),T:1497.0(57.75%),B:21513.5(46.33%),P:1e-30','1-CSGATGAAT,CNhs12011,BestGuess:Pdx1(Homeobox)/Islet-Pdx1-ChIP-Seq/Homer(0.678135376239164),T:462.0(37.62%),B:11082.2(23.47%),P:1e-27','1-GGAGGAGRAGG,CNhs13817,BestGuess:MZF1.p2.SwissRegulon.nucfreq(0.73663833101872),T:834.0(34.32%),B:11155.7(23.85%),P:1e-30','1-TATKWNTTCMGTGTY,BestGuess:PB0012.1_Elf3_1(0.645092744449619),T:56.0(2.15%),B:42.5(0.09%),P:1e-44','1-TGAGTCATTTCCT,CNhs10837,BestGuess:BATF_si_HM09(0.744616642587065),T:140.0(15.12%),B:2484.2(5.17%),P:1e-28','1-TGGTCCYSCTGGTCC,BestGuess:MA0267.1_ACE2(0.614022138603491),T:70.0(3.79%),B:93.8(0.20%),P:1e-62','1-TWTTWVNSCS,CNhs11086,BestGuess:HMGA1_f1_HM09(0.621491710547325),T:376.0(31.95%),B:8855.4(18.54%),P:1e-27','10-ACTTCCTCTTCC,CNhs12563,BestGuess:PU.1(ETS)/ThioMac-PU.1-ChIP-Seq/Homer(0.742292052878174),T:576.0(13.16%),B:3275.9(7.45%),P:1e-38','10-ATCGATTG,BestGuess:HNF6(Homeobox)/Liver-Hnf6-ChIP-Seq(ERP000394)(0.719249319691647),T:2807.0(39.90%),B:13696.2(32.89%),P:1e-29'];
var pval = [1,1,1,1,6.13482e-09,1,1,1,1,1,0.999604,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.00708028,1,1,1,1,0.999946,1,1,1,1,1,0.997015,1,1,1,1,1,1,1,1,0.999984,1,1,1,0.00816367,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.0100364,1,1,0.96714,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.999993,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,5.89797e-08,0.999999,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.993238,1,1,1,1,1,1,1,1,0.0390238,1,1,0.343053,1,1,0.980803,1,1,1,0.999689,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.825871,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.997359,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.999947,1,1,0.998966,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.911901,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.999755,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.000493084,8.77295e-51,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.998598,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.999987,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.999974,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0,1,1,1,1,1,1,1,0.991086,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.906871,1,0.994737,1,0.834479,1,0.997178,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.993321,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1.05417e-08,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.835013,1,9.23934e-10,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.997324,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.999999,0.938664,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.337207,1,1,1,1,1,1,0.999988,1,1,1,0.645058,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.999992,1.51362e-09,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.988897,1,0.99984,1,1,1,0.999998,1,1,0.989695,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,9.93892e-06,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.702219,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,6.60378e-15,1.49915e-09,1,1,1,7.26153e-12,1.56756e-07,1,1,0.560302,1,1,0.199247,1.76124e-05,0.99994,1,1,1,2.55112e-06,0.323866,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1.42689e-05,1,1,1,0.561362,1,1,1,0.0545097,1,5.60293e-08,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.003232,1,0.999999,1,1,1,1,1.86691e-11,1,1,1,1,0.879851,0.953685,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.606544,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.999975,1,1,1,0.999998,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.00434176,1,1,1,0.999999,1,1,1,1,1,1,1,0.999999,1,1,1,1,1,1,1,0.99999,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.999976,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.998762,1,0.303727,1,1,2.07678e-05,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.999991,1,2.07441e-34,1,0.957223,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.999946,1,1,1,0.999943,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1];
var pval = [1,1,1,1,6.13482e-09,1,1,1,1,1,0.999604,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.00708028,1,1,1,1,0.999946,1,1,1,1,1,0.997015,1,1,1,1,1,1,1,1,0.999984,1,1,1,0.00816367,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.0100364,1,1,0.96714,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.999993,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,5.89797e-08,0.999999,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.993238,1,1,1,1,1,1,1,1,0.0390238,1,1,0.343053,1,1,0.980803,1,1,1,0.999689,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.825871,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.997359,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.999947,1,1,0.998966,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.911901,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.999755,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.000493084,8.77295e-51,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.998598,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.999987,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.999974,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0,1,1,1,1,1,1,1,0.991086,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.906871,1,0.994737,1,0.834479,1,0.997178,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.993321,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1.05417e-08,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.835013,1,9.23934e-10,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.997324,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.999999,0.938664,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.337207,1,1,1,1,1,1,0.999988,1,1,1,0.645058,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.999992,1.51362e-09,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.988897,1,0.99984,1,1,1,0.999998,1,1,0.989695,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,9.93892e-06,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.702219,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,6.60378e-15,1.49915e-09,1,1,1,7.26153e-12,1.56756e-07,1,1,0.560302,1,1,0.199247,1.76124e-05,0.99994,1,1,1,2.55112e-06,0.323866,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1.42689e-05,1,1,1,0.561362,1,1,1,0.0545097,1,5.60293e-08,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.003232,1,0.999999,1,1,1,1,1.86691e-11,1,1,1,1,0.879851,0.953685,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.606544,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.999975,1,1,1,0.999998,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.00434176,1,1,1,0.999999,1,1,1,1,1,1,1,0.999999,1,1,1,1,1,1,1,0.99999,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.999976,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.998762,1,0.303727,1,1,2.07678e-05,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.999991,1,2.07441e-34,1,0.957223,1,1,1,1,1,1,1,1,1,0.999946,1,1,1,0.999943,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1];
var data = [];
var data = [];

Revision as of 13:53, 8 August 2012

motif without matrices Swissregulon:SRY.p1 Swissregulon:HOX(A,B,D)3.p1

doubled top motif tables CNhs10855 & CNhs11062 CNhs11245 & CNhs11183 CNhs11248 & CNhs11185 CNhs11772 & CNhs12996 CNhs11781 & CNhs12997


enrichment analysis


20120808135337 yes

20240614145405

{{#sparql: SELECT * WHERE { ?x ?y ?z FILTER regex(?z, "GO") } LIMIT 10 |endpoint=http://go.bio2rdf.org/sparql/ |footer=NO }}




Retrieved from "http://f5-webapp4.gsc.riken.jp/resource_browser/index.php?title=User:Hisa&oldid=1984667"