MacroAPE 1083:ARI5B f1
From FANTOM5_SSTAR
Full Name: ARI5B_f1
| Motif matrix | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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Sample specificity
The values shown are the p-values of the motif in FANTOM5 samples. <br>Analyst: Michiel de Hoon
TomTom analysis
<br>Analyst: Michiel de Hoon and Hiroko Ohmiya
Target_ID | Optimal_offset | p-value | E-value | q-value | Overlap | Query consensus | Target consensus | Orientation |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Pax4#MA0068.1 | 9 | 0.00142603 | 0.678791 | 1 | 13 | TGTTGGTATTGTG | GGGGGGGGAGTGGAGTATTGGAAATTTTTC | - |
| MGA1#MA0336.1 | 1 | 0.00251032 | 1.19491 | 1 | 13 | TGTTGGTATTGTG | TTTAGAGTGTTCTATAGTCCT | - |
| NDT80#MA0343.1 | 0 | 0.0071693 | 3.41259 | 1 | 13 | TGTTGGTATTGTG | TTGCGTTTTTGTGGCCGGAAA | - |
| Sox17#MA0078.1 | -4 | 0.0136469 | 6.49592 | 1 | 9 | TGTTGGTATTGTG | TTCATTGTC | + |
| odd#MA0454.1 | -2 | 0.0137335 | 6.53714 | 1 | 11 | TGTTGGTATTGTG | CTGCTACTGTT | - |
| Cebpa#MA0102.1 | -4 | 0.0158666 | 7.55249 | 1 | 9 | TGTTGGTATTGTG | GAGATTGCGAAA | - |
| BRCA1#MA0133.1 | -5 | 0.0159504 | 7.59237 | 1 | 7 | TGTTGGTATTGTG | GTGTTGT | - |
| HMG-1#MA0044.1 | -2 | 0.020301 | 9.66329 | 1 | 9 | TGTTGGTATTGTG | GTTGTACTC | + |
