MacroAPE 1083:GCCGCTTTAA,motif411
From FANTOM5_SSTAR
Full Name: GCCGCTTTAA,motif411,CNhs10638,T:311.0(9.06%),B:2703.9(4.25%),P:1e-33
| Motif matrix | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
Sample specificity
The values shown are the p-values of the motif in FANTOM5 samples. <br>Analyst: Michiel de Hoon
TomTom analysis
<br>Analyst: Michiel de Hoon and Hiroko Ohmiya
Target_ID | Optimal_offset | p-value | E-value | q-value | Overlap | Query consensus | Target consensus | Orientation |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MNB1A#MA0053.1 | -3 | 0.00116843 | 0.556171 | 0.653409 | 5 | GCCGCTTTAA | GCTTT | - |
| Dof3#MA0021.1 | -2 | 0.00193347 | 0.920334 | 0.653409 | 6 | GCCGCTTTAA | CGCTTT | - |
| PBF#MA0064.1 | -3 | 0.00219272 | 1.04374 | 0.653409 | 5 | GCCGCTTTAA | GCTTT | - |
| Dof2#MA0020.1 | -2 | 0.00274542 | 1.30682 | 0.653409 | 6 | GCCGCTTTAA | TGCTTT | - |
| TBP#MA0108.2 | 2 | 0.00591218 | 2.8142 | 0.867972 | 10 | GCCGCTTTAA | CCCCGCCTTTTATAC | - |
| TBP#MA0108.2 | 2 | 0.00591218 | 2.8142 | 0.867972 | 10 | GCCGCTTTAA | CCCCGCCTTTTATAC | - |
| SMP1#MA0383.1 | 1 | 0.00638215 | 3.0379 | 0.867972 | 10 | GCCGCTTTAA | TGCTAATTTAATTATAGGTAA | - |
| ARID3A#MA0151.1 | -5 | 0.00932844 | 4.44034 | 1 | 5 | GCCGCTTTAA | TTTAAT | - |
| ceh-22#MA0264.1 | 0 | 0.0109633 | 5.21854 | 1 | 10 | GCCGCTTTAA | ACCACTTGAAA | + |
| YER130C#MA0423.1 | 0 | 0.0190169 | 9.05206 | 1 | 9 | GCCGCTTTAA | ACCCCTATT | + |
