MacroAPE 1083:NKX22 si

Full Name: NKX22_si

Motif matrix

PO A C G T 1 2.4146341463414642 2.853658536585376 7.585365853658546 11.634146341463437 2 5.707317073170728 0.0 1.6585365853658538 17.121951219512205 3 0.0 7.902439024390261 2.536585365853662 14.048780487804901 4 24.4878048780488 0.0 0.0 0.0 5 24.4878048780488 0.0 0.0 0.0 6 0.0 0.0 24.4878048780488 0.0 7 0.878048780487806 0.0 0.0 23.609756097561 8 8.78048780487806 0.878048780487806 14.829268292682942 0.0 9 0.4390243902439018 8.341463414634148 10.536585365853657 5.170731707317082 10 2.6341463414634205 0.878048780487806 1.3170731707317076 19.65853658536587 11 2.1951219512195137 0.0 1.756097560975612 20.536585365853668 12 6.58536585365855 3.073170731707332 6.048780487804882 8.78048780487806

Sample specificity

The values shown are the p-values of the motif in FANTOM5 samples. <br>Analyst: Michiel de Hoon

TomTom analysis

<br>Analyst: Michiel de Hoon and Hiroko Ohmiya

Target_ID	Optimal_offset	p-value	E-value	q-value	Overlap	Query consensus	Target consensus	Orientation
bap#MA0211.1	-1	5.05211e-06	0.00240481	0.0047428	7	TTTAAGTGGTTT	TTAAGTG	+
ceh-22#MA0264.1	1	0.000114787	0.0546388	0.0538798	10	TTTAAGTGGTTT	TTTCAAGTGGT	-
Nkx3-2#MA0122.1	-1	0.00024477	0.11651	0.0740487	9	TTTAAGTGGTTT	TTAAGTGGA	+
tin#MA0247.1	0	0.000315512	0.150184	0.0740487	8	TTTAAGTGGTTT	CTCAAGTG	+
Nkx2-5#MA0063.1	-1	0.000710727	0.338306	0.133443	7	TTTAAGTGGTTT	TTAATTG	+
vnd#MA0253.1	1	0.000962041	0.457932	0.150523	8	TTTAAGTGGTTT	TTTCAAGTG	+
z#MA0255.1	-1	0.00172597	0.821564	0.231472	10	TTTAAGTGGTTT	TTGAGTGATT	+
Nobox#MA0125.1	-2	0.00384116	1.82839	0.443969	8	TTTAAGTGGTTT	TAATTGGT	+
NK7.1#MA0196.1	-1	0.00425631	2.026	0.443969	7	TTTAAGTGGTTT	TTAATTG	+
Vsx2#MA0180.1	0	0.00751189	3.57566	0.541094	9	TTTAAGTGGTTT	TTTAATTAG	+
MAX#MA0058.1	-1	0.00799684	3.8065	0.541094	10	TTTAAGTGGTTT	TCACGTGGTC	-
En1#MA0027.1	-3	0.00871819	4.14986	0.541094	9	TTTAAGTGGTTT	AAGTAGTGCCC	+
NKX3-1#MA0124.1	-2	0.00929292	4.42343	0.541094	7	TTTAAGTGGTTT	TAAGTAT	-
CG15696#MA0176.1	-1	0.00985465	4.69082	0.541094	7	TTTAAGTGGTTT	TTAATTA	+
hbn#MA0226.1	-1	0.00985465	4.69082	0.541094	7	TTTAAGTGGTTT	TTAATTA	+
unc-4#MA0250.1	-1	0.00985465	4.69082	0.541094	7	TTTAAGTGGTTT	TTAATTG	+
Hmx#MA0192.1	-1	0.0104458	4.97221	0.541094	7	TTTAAGTGGTTT	TTAATTG	+
ARR1#MA0274.1	1	0.0117057	5.57189	0.541094	7	TTTAAGTGGTTT	ATTCAAGT	-
slou#MA0245.1	-1	0.011725	5.58109	0.541094	7	TTTAAGTGGTTT	TTAATTA	+
CG32532#MA0179.1	-1	0.0124166	5.91029	0.541094	7	TTTAAGTGGTTT	TTAATTA	+
B-H2#MA0169.1	-1	0.0131448	6.25694	0.541094	7	TTTAAGTGGTTT	TTAATTG	+
CG7056#MA0183.1	0	0.0136835	6.51333	0.541094	8	TTTAAGTGGTTT	TTTAATTA	+
Ubx#MA0094.2	0	0.0144052	6.85686	0.541094	8	TTTAAGTGGTTT	TTTAATTA	+
CG13424#MA0175.1	-1	0.0147174	7.00547	0.541094	7	TTTAAGTGGTTT	TTAATTG	+
RUNX1#MA0002.2	-1	0.0151959	7.23323	0.541094	11	TTTAAGTGGTTT	GTCTGTGGTTT	+
tup#MA0248.1	-1	0.0155623	7.40766	0.541094	7	TTTAAGTGGTTT	TTAATTG	+
CG34031#MA0444.1	-1	0.0155623	7.40766	0.541094	7	TTTAAGTGGTTT	TTAATTG	+
RUNX1#MA0002.2	-1	0.0166205	7.91137	0.557248	11	TTTAAGTGGTTT	TATTGTGGTTA	+
CG11085#MA0171.1	-1	0.0173786	8.27223	0.562574	7	TTTAAGTGGTTT	TTAATTG	+
en#MA0220.1	-1	0.0183541	8.73654	0.56848	7	TTTAAGTGGTTT	TTAATTA	+
B-H1#MA0168.1	-1	0.0193778	9.22381	0.56848	7	TTTAAGTGGTTT	TTAATTG	+
C15#MA0170.1	-1	0.0193778	9.22381	0.56848	7	TTTAAGTGGTTT	TTAATTA	+
Dr#MA0188.1	-2	0.0204491	9.73379	0.57854	7	TTTAAGTGGTTT	TAATTGG	-