MacroAPE 1083:RFX1 NPC-Rfx1-ChIP-Seq/Homer
From FANTOM5_SSTAR
Full Name: RFX1_NPC-Rfx1-ChIP-Seq/Homer
| Motif matrix | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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Sample specificity
The values shown are the p-values of the motif in FANTOM5 samples. <br>Analyst: Michiel de Hoon
TomTom analysis
<br>Analyst: Michiel de Hoon and Hiroko Ohmiya
Target_ID | Optimal_offset | p-value | E-value | q-value | Overlap | Query consensus | Target consensus | Orientation |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RFX1#MA0365.1 | 0 | 0.000182017 | 0.0866403 | 0.173281 | 8 | GGTTGCCATGGCAA | GGTTGCTA | + |
| YY1#MA0095.1 | -4 | 0.00980139 | 4.66546 | 1 | 6 | GGTTGCCATGGCAA | GCCATC | + |
| ESR1#MA0112.2 | 6 | 0.010577 | 5.03465 | 1 | 14 | GGTTGCCATGGCAA | AGGTCAGGGTGACCTGGGCC | - |
| RIM101#MA0368.1 | -3 | 0.0106065 | 5.0487 | 1 | 7 | GGTTGCCATGGCAA | CGCCAAG | + |
| ESR1#MA0112.2 | 3 | 0.011095 | 5.28121 | 1 | 14 | GGTTGCCATGGCAA | CCAGGTCACCGTGACCCC | + |
| Sox2#MA0143.1 | 1 | 0.0135394 | 6.44477 | 1 | 14 | GGTTGCCATGGCAA | CCTTTGTTATGCAAA | + |
| Pou5f1#MA0142.1 | 0 | 0.0149018 | 7.09324 | 1 | 14 | GGTTGCCATGGCAA | CTTTGTTATGCAAAT | + |
