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User:Hisa/FFsampletest: Difference between revisions

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<TR><th><div align="center"><b>Rank</b><div></th><th><b><div align="center"><b>Motif</b><div></th><th>Target hits</th><th>Background</th><th>P-value</th><th><div align="center"><b>Best Match/Details<br> and Motif File</b></div></th></TR>
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Revision as of 14:21, 6 June 2012

Rank
Motif
Target hitsBackgroundP-value
Best Match/Details
and Motif File
1 9.14%1.14%1e-264JUN.p2.SwissRegulon.nucfreq
2 11.38%2.45%1e-209SOX10_si_HM09

1motif1_TCGNAG
10motif10_SCGGAGASN
100motif100_GCYTNCTC
101motif101_NAGCAASA
102motif102_GCAAMGT
103motif103_CGGCTAWWT
104motif104_GTWSGMT
105motif105_KTNGNAGWMG
106motif106_KCGCANTC
107motif107_CGTCTGCGTA
108motif108_AACKSARM
109motif109_TCNMTMGC
11motif11_GCGANT
110motif110_AGTCGCAGCG
111motif111_WWAATYCGCTCC
112motif112_CGYGYAWT
113motif113_YGAGCTRTG
114motif114_AAACCCGCTC
115motif115_CATCAACTAC
116motif116_CCAARA
117motif117_SKSNGCGCTSN
118motif118_AATCCGGCT
119motif119_TCAAAANCG
12motif12_ACTAAG
120motif120_TTSMTGNNGKTG
121motif121_TGCAWTGTA
122motif122_TACAAYGGM
123motif123_TTGATGCAGTGA
124motif124_AATNCANCACT
125motif125_TTTAACTCGT
126motif126_AATGCAGTCG
127motif127_TTTTTACCCTC
128motif128_NNGNATRCGWN
129motif129_CTCGTAATCT
13motif13_GAGGATGCK
130motif130_TTTCAAACNCCC
131motif131_CTGCTTAAATA
132motif132_TCRCCAGWY
133motif133_TWTAWAGTWGRAG
134motif134_ATAAGAGAGGC
135motif135_TNKYTGCAKA
136motif136_GTCTGCGTCTCT
137motif137_MAACAGAAGY
138motif138_CTTTWANNYCC
139motif139_CGTTCGAATT
14motif14_TCNACG
140motif140_WTAAATAACG
141motif141_TTAAACGGC
142motif142_TCATATAGAGAAGC
143motif143_ATGATGTG
144motif144_AAKCMSGT
145motif145_GMAGWCGMAW
146motif146_AGACGAAGA
147motif147_ATATCCAGTG
148motif148_NTCSYSTYT
149motif149_CAAGCTGTACA
15motif15_ACTGTG
150motif150_AGCACAGGCG
151motif151_GCCYGTGCMKCW
152motif152_GCKYRMKCGS
153motif153_ACTYNYYATYG
154motif154_GRWGGCAARCG
155motif155_AATARSTCCC
156motif156_ACTGTAGGACMT
157motif157_AAACTWACC
158motif158_SRCGWYACA
159motif159_ACACATACTACA
16motif16_ACCAG
160motif160_AGCCGGTAACG
161motif161_CGGCTTGATT
162motif162_AGTTACCGTCA
163motif163_GARTCGCCCTGTNA
164motif164_AGCCGATTTG
165motif165_AAAGTTACTG
166motif166_TAMAACTTTGS
167motif167_TTGGGTAGGAG
168motif168_TCTCAGAGTATAAA
169motif169_GCCTGGCC
17motif17_CGCTAN
18motif18_CATCAG
19motif19_GYTGGMC
2motif2_GCTGGAGG
20motif20_TGNAGC
21motif21_TCTTGA
22motif22_GGMCTG
23motif23_CGCNAT
24motif24_AGAACT
25motif25_GATCCN
26motif26_CTCCGCAGTA
27motif27_CCTGCA
28motif28_CGTNCA
29motif29_TAGCTCGGCT
3motif3_CGCTNA
30motif30_AGNTCC
31motif31_AGNCGT
32motif32_TRGNMCTNNT
33motif33_AGAGCATGAGACGG
34motif34_GANCCT
35motif35_CGCCYAGA
36motif36_AAGGAGRAN
37motif37_GCTCGCA
38motif38_TCGNCA
39motif39_CCAAGT
4motif4_TGTCTA
40motif40_ATGCGGAGGAG
41motif41_TSACAA
42motif42_CGNTCA
43motif43_CCCWGT
44motif44_TGAAGST
45motif45_GCTCNGG
46motif46_CGNAGT
47motif47_CGAGTN
48motif48_CANTCG
49motif49_ACAGRG
5motif5_CAGTGT
50motif50_GTCCNA
51motif51_CGGNTA
52motif52_CGNATG
53motif53_ANGCTG
54motif54_CGNGTA
55motif55_CGTTATAGCC
56motif56_GANCGT
57motif57_AGGCAT
58motif58_CGGNAT
59motif59_NCWCCARNR
6motif6_AAGACT
60motif60_GCGNAT
61motif61_KAYMGMTN
62motif62_CGNGAT
63motif63_GTNCCA
64motif64_AGTCGN
65motif65_TNGCGA
66motif66_ACCGRTCA
67motif67_GNTAAC
68motif68_CTTTTAAAC
69motif69_RYKNAAATC
7motif7_CGNATC
70motif70_MAATCGC
71motif71_CTCCGCW
72motif72_CAGAAMC
73motif73_GAGCKMGC
74motif74_TTKAAAY
75motif75_AGCCGAGCGCT
76motif76_GGAGCAGCCAAT
77motif77_TCCTTGG
78motif78_NCGNWGCAWN
79motif79_ACATCTACAA
8motif8_CCATGN
80motif80_CTCTGAGAGAA
81motif81_NGCAGAA
82motif82_TTGAATCGCGG
83motif83_TTWTAAA
84motif84_GGKTTYT
85motif85_TWNNGCSNA
86motif86_CGCACAGACCGCGC
87motif87_RCGCACWS
88motif88_CCCTCTTT
89motif89_CGCCGTGTTTA
9motif9_ANGGCT
90motif90_TTATATCGC
91motif91_TTCTTTCG
92motif92_GCGKWWNAA
93motif93_TANTMTCTRWAT
94motif94_CATYTSA
95motif95_AGCGAGCTAGC
96motif96_TKNTTCTGTCTN
97motif97_TTCCCT
98motif98_GCCGAAGATT
99motif99_GYGTSANACG
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